Kwa kawaida, mito ya Nepal inaweza kugawanywa katika vikundi vitatu (kulingana na aina ya chakula). Ya kwanza ni mito ambayo hulishwa na kuyeyuka kwa barafu. Ya pili ni mito inayotokana na kigongo cha Mahabharat. Wengine pia ni mito na mito anuwai, ambayo chanzo chake ni kwenye ukingo wa Sivalik.
Mto wa Bagmati
Bagmati hupita katika nchi za Nepal ya kati na jimbo la India la Bihar. Chanzo cha mto huo uko milimani na huundwa na makutano ya mito kadhaa isiyo na jina (kama kilomita 15 kutoka Kathmandu).
Maji ya Bagmati ni matakatifu katika Uhindu na Ubudha. Kuna mahekalu mengi ya Wahindu kwenye ukingo wa mto.
Mto Barun
Barun hupita katika maeneo ya mashariki mwa Nepal ya kati na ndiye mto wa kulia wa Mto Arun.
Chanzo cha mto huo ni barafu za Berun ziko kwenye mlima wa Makalu. Mwelekeo kuu wa sasa ni mashariki na kusini mashariki. Mto huo ni sehemu ya mfumo wa mto Kosi, ambao unajumuisha mito mikubwa kama: Arun; Tamur; Sun-Kosi; Indravati; Dudh Kosi; Bhola Kosi.
Mto Gandak
Mto huo unapita kati ya eneo la Nepal na India. Gandak ni moja ya mito minne mikubwa zaidi ya Nepali. Chanzo cha mto ni katika Himalaya, kwenye makutano ya mito miwili: Muztang Khola; Kyugoma Khola. Katika sehemu za juu, mto huo unaitwa Kali-Gandak. Makutano ya Gandak ni maji ya Mto Ganges. Bonde la mto lilikuwa njia ya biashara inayounganisha India na Tibet.
Bonde la Mto Gandak pia linavutia kwa sababu hugawanya Mlango Mkubwa wa Himalaya katika sehemu mbili, ukipita kati ya kilele mbili - Annapura na Daulagiri.
Mto Ghaghra
Ghaghra hupita katika nchi za majimbo matatu - Nepal, China na India. Urefu wa jumla wa sasa ni kilomita 950 na huu ndio mkondo wa maji wa kina kabisa ambao unalisha Ganges kubwa.
Chanzo cha mto huo kiko kwenye eneo la Bonde la Tibetani (sehemu ya kusini, eneo la Ziwa Manasarovar). Ghaghra ni mto mrefu na mkubwa zaidi ulioko Nepal. Aina kuu ya kulisha mito: katika sehemu za juu ni maji ya barafu na theluji iliyoyeyuka; fika chini hulishwa wakati wa kipindi cha doji. Mto huo unajaa haswa katika msimu wa joto na msimu wa joto. Wakati huu wa mwaka, mafuriko makubwa yanawezekana huko Ghaghra. Maji ya mto hutumiwa hasa kwa umwagiliaji.
Mto Dudh-Kosi
Moja ya mito ya Nepalese, ambayo ni moja ya mito ya milima mirefu sio tu nchini, bali ulimwenguni kote. Chanzo cha mto ni Ziwa Gokyo. Halafu mkondo unashuka kwenye njia Namche-Bazar, ambapo maji ya Dudh-Kosi yanaungana na mto mwingine - Bhote-Kosi.
Mto huo ni mzuri tu kwa rafting, lakini inapaswa kuzingatiwa kuwa njia hii haifai kwa Kompyuta.
Mto Rapti
Rapti ni mto katika Nepal na India, na jumla ya urefu wa kilomita 600. Chanzo cha mto ni katika eneo la milima ya Sivalik.