Mito ya Estonia ni ndogo sana na kati ya mito mia saba ya nchi hiyo, ni tisa tu wanaweza kujivunia kushinda alama ya kilomita mia moja.
Mto Piusa
Piusa hupita katika wilaya za majimbo mawili - Jamhuri ya Estonia na Urusi. Urefu wa kitanda cha mto ni kilomita tisini na tatu. Mgawanyiko ni kama ifuatavyo: Estonia inamiliki Piusa kilomita themanini; sehemu ya eneo la Urusi ilifikia kilomita kumi na tatu ndogo. Eneo la jumla la samaki ni kilomita za mraba 796.
Chanzo cha mto huo kiko kwenye ardhi ya Kiestonia katika maji ya Ziwa Alasjärv (kijiji cha Villa, kilicho upande wa kusini magharibi kutoka kwa kijiji cha Vastseliina - kilomita kumi na mbili). Kinywa cha mto ni kioo cha Ziwa Peipsi, sio mbali na kijiji cha Budovizh. Katika makutano, Piusu hugawanyika, ikitiririka ziwa katika matawi mawili.
Njia ya kati ya mto - kilomita kumi na nane kati ya vijiji vya Vastseliina na Saetamme - huendesha mashimo mazuri. Ilikuwa yeye ambaye alikuja mahali ambapo hifadhi hiyo ilipangwa. Ilianzishwa mnamo 1965 na inashughulikia eneo lenye eneo la zaidi ya kilomita za mraba tisa.
Mto Võhandu
Võhandu ni njia ya maji ndefu zaidi katika jamhuri. Urefu wake wote ni sawa na kilomita mia moja sitini na mbili. Chanzo cha Võhandu iko karibu na makazi ya Waestonia ya Saverna. Baada ya hapo, hupita kwenye kina cha Ziwa Jiksi na kumaliza safari, ikiunganisha na maji ya Ziwa Joto. Hii hufanyika mbali na kijiji cha Võõpsu.
Ni muhimu kukumbuka kuwa kabla ya Ziwa Vagula, wakazi huita mto huu Pyhajõgi, lakini baada ya kutoka kwa maji yake - Voo.
Vyombo vinasafiri kando ya mto kando ya sehemu iliyofungwa na Ziwa Peipsi na bandari iliyoko katika eneo la kijiji cha Võõpsu. Mito mingi ni wauzaji wakuu wa maji kwa Võhandu.
Mto Parnu
Pärnu ni mto wa Kiestonia na jumla ya urefu wa kilomita mia moja arobaini na nne. Jumla ya eneo la kuvua samaki ni karibu kilomita za mraba saba. Chanzo cha mto ni ziwa dogo lenye asili ya chemchemi (sio mbali na Roosno-Alliku), lakini linaisha njia ya Pärnu, inayoingia ndani ya maji ya Ghuba la Pärnus (sehemu ya Ghuba ya Riga, eneo la maji la Baltic).
Mto unalishwa mchanganyiko. Na ikiwa katika sehemu za juu, maji ya chini ya ardhi huwa wauzaji, basi katika sehemu za chini kuna mvua. Mto sio wakati wote huganda wakati wa baridi. Ikiwa hii itatokea, basi barafu huunda kutoka karibu muongo wa pili wa Desemba na hudumu hadi mwisho wa Machi.
Mto huo unaweza kusafiri karibu tu na mahali pa mkutano wake. Kitanda cha mto kimezuiwa na mabwawa katika maeneo kumi na moja.