Mito mingi ya Honduras ina milima. Na orodha ya mito mikubwa katika jamhuri nzima inafunguliwa - Patuka, Ulua na Aguan.
Mto Aguan
Mto hupita katika maeneo ya kaskazini mwa Honduras, kuanzia idara ya Yoro. Halafu anaendelea na safari, akichagua mwelekeo wa mashariki, akivuka nchi za idara ya Colon. Na safari inaisha kwa kutiririka kwenye maji ya Bahari ya Karibiani (karibu na Santa Rosa de Aguán). Urefu wa jumla wa sasa unafikia karibu kilomita mia nne. Aguana ina vijito kadhaa.
Bonde la mto linatumika kikamilifu katika kilimo. Kwenye bonde katika sehemu ya juu / katikati ya mto, kuna mashamba ya mboga, na pia mashamba ya mahindi na maharagwe. Bonde la maeneo ya chini hutolewa kwa mchele na matunda ya machungwa. Mitende ya mafuta na mkuyu pia hupandwa hapa.
Mto Riu-Sumpul
Rio Sumpul inapita katika nchi za majimbo mawili mara moja - El Salvador (sehemu yake ya kaskazini magharibi) na Honduras (wilaya za kusini magharibi). Mto huo ni mfupi sana - kilomita sabini na saba tu - na kwa urefu wake wote hutumika kama mpaka unaogawanya wilaya za majimbo haya.
Chanzo cha Rio Simpul iko katika El Salvador. Huko mto unavuka manispaa kadhaa (zote ziko katika idara moja - Chalatenango). Inapita ndani ya maji ya Rio Lempa.
Mto Rio Torola
Rio Torola hupita Amerika ya Kati, ikipita katika nchi za El Salvador (kaskazini mashariki) na Honduras (sehemu ya kusini ya jamhuri). Muda wote wa Rio Torola ni zaidi ya kilomita mia moja. Mto huanzia katika eneo la Salvador mahali ambapo mto wa Lahitas unaungana na mto Mansukupagua. Kinywa cha Rio Torola ni maji ya Rio Lempa.
Mto Ulua
Kitanda cha mto kinapitia eneo la Honduras katika sehemu yake ya kaskazini, kuanzia ardhi ya idara ya Intibuca (sio mbali na La Paz, mteremko wa milima ya Cordillera de Mentesillos). Urefu wa jumla wa sasa ni kilomita 358 na eneo la jumla la vyanzo vya mraba karibu elfu ishirini na tatu.
Mto huundwa na makutano ya mito ya Sasagua na Puringla. Juu yake inajulikana kama Rio Grande de Otoro. Hapo awali, mto unapita kaskazini, ukivuka Santa Barbara katika safari, lakini baada ya hapo Ulua hugeuka sana kuelekea magharibi na, ukipita idara tatu - Yoro, Cortes na Atlantis - inakamilisha njia katika maji ya Ghuba ya Honduras.
Mto Goaskoran
Goaskoran anawaka moto kupitia ardhi ya Honduras na El Salvador, akivuka nchi za kusini. Urefu wa sasa ni karibu kilometa mia moja thelathini na eneo lenye vyanzo vya kilomita za mraba elfu mbili mia sita sitini na tatu.
Kilomita kumi na nane za mwisho wa sasa ni mpaka wa asili kati ya majimbo hayo mawili. Maji ya Goaskoran ni chanzo cha maji ya kunywa kwa wakazi wa nchi wanaoishi kwenye mwambao wake.