Mito ya Tajikistan imejaa kamili na haswa ni ya bonde la Bahari ya Aral. Na ni machache tu yanayotiririka ndani ya maji ya Ziwa Karakul au Mto Tarima.
Mto Amu Darya
Kituo cha Amu Darya kinapita katika eneo la nchi nne mara moja - Afghanistan, Tajikistan, Uzbekistan na Turkmenistan. Urefu wa kituo ni kilomita 2,400. Kati ya hizi, kilomita 1,415 hupita nchini. Chanzo cha Amu Darya huundwa na mkutano wa mito miwili - Vakhsh na Pyanj. Kinywa cha mto ni maji ya Bahari ya Aral (kwenye mkutano huunda delta kubwa).
Kuna mito michache karibu na mto. Kwa wastani, Amu Darya hupokea maji ya Kafirnigan, Surkhandarya na Sherebad, na vile vile mto mmoja wa kushoto - Mto Kunduz. Na zaidi, hadi mahali pa makutano, hakuna tawimito zaidi. Maji ya mto hutumiwa kikamilifu, na kwa hivyo Amu Darya haifiki Bahari ya Aral. Hii ndio haswa ambayo ikawa moja ya sababu za kukauka kwake.
Katika maji ya Amu Darya, kuna aina kadhaa tofauti za samaki: asp; mtu mwenye upara; samaki wa samaki wa paka; bream; samaki wa samaki; carp ya fedha; Amur nyeupe; chuki.
Mto Vanj
Moja ya mito, ambayo chaneli yake iko peke katika eneo la Tajikistan. Ni mto wa kulia wa Mto Pyanj. Urefu wa mto huo ni kilomita 103. Chanzo huundwa na makutano ya mito miwili - moja huteremka kutoka kwa barafu za mto wa Vanch, na nyingine kutoka kwenye ukingo wa Chuo cha Sayansi (mteremko wa magharibi). Kituo kinaendesha kati ya matuta ya Vanch na Darvaz.
Mto Kashkadarya
Kitaifa, kitanda cha mto kinapita katika nchi za Tajikistan (mkoa wa Sughd) na Uzbekistan (mkoa wa Kashkadarya). Kwa kawaida, mto huo una majina matatu: katika sehemu za juu - Obikhunda; kozi ya kati - Shinachasai; chini - Maimanakadarya.
Urefu wa kituo ni kilomita 378. Chanzo cha mto huo ni katika urefu wa mita 2960 juu ya usawa wa bahari na huundwa na mito miwili isiyojulikana. Mito kubwa: Akdarya (Aksu); Tanhidizadarya; Guzardarya.
Mto Muksu
Urefu wa kituo ni kilomita 88. Muksu iko katika mkoa wa Jirgatal wa Tajikistan. Chanzo ni mkutano wa mito miwili: Seldara na Sauksoy (Fedchenko na Bolshoi Saukdar glaciers).
Mto wa Kuzylsu
Kyzylsu, ambayo inamaanisha "mto mwekundu", inapita katika eneo la Kyrgyzstan na Tajikistan. Chanzo ni mteremko wa Trans-Alai Range. Urefu wa kituo ni kilomita 235. Katika mkutano na Mto Muksu, hutoa Mto Vakhsh.
Mto Vakhsh
Urefu wa kituo cha mto ni kilomita 786, na zote hupita katika eneo la Tajikistan. Chanzo cha mto ni kwenye mteremko wa Pamir, lakini mahali pa mkutano wake na maji ya Mto Pyanj hutoa Amu Darya mkubwa. Mto ni chanzo kikuu cha umwagiliaji na pia uzalishaji wa umeme.
